丰臣秀吉以和谈争取时间，重整军备，准备再次入侵，故驻在釜山的日军始终未退。而明神宗不听大臣的建议，将各镇兵相继撤回国内。万历二十五年，日军发动14万多人第二次进攻朝鲜。明政府即派兵部尚书邢玠为总督，第二次出兵朝鲜。邢玠下令逮捕内奸沈惟敬，布置诸将兵分三路进攻，迫使日军退守朝鲜半岛南端的岛山。明李如梅部裨将身先士卒，冒着弹雨猛攻敌营，正待要攻破之时，明军内部争功，竟鸣金收兵。以后大军猛攻十昼夜都攻不下，小西行长突然率军来救，经略杨镐非常害怕，狼狈逃跑，诸军继之大溃，士卒死伤将近2万，明军撤回了王京。总督邢玠接受前一战役的教训，专门招募江南水师，增强了前线的战斗力。万历二十六年十月，有报说丰臣秀吉已死，日军军心动摇，中朝军队便加紧了攻势，明总兵陈璘率水师1.3万余人分守诸海口，与陆军配合，焚敌船百余艘。日军大队企图从海上逃走，中朝水军在海上布开阵势，朝鲜名将李舜臣亲自驾船冲入敌阵。李舜臣创造的朝鲜龟船坚固巧妙，进退自如，在战斗中起了很大作用。明朝70岁的老将邓子龙率领壮士200人，登上朝鲜船奋战，杀敌无数，不幸战船起火，全体将士壮烈牺牲。李舜臣击沉数艘敌船，身中流弹，临死前嘱咐身边的侄子说：“战斗正紧，不要把我阵亡的消息传出去。” 中朝军队并肩作战，相互救援，英勇杀敌，结果全歼日本水军，击沉敌舰900多艘。战斗结束，陈璘急忙在阵前寻找李舜臣欲共庆胜利，这时才听说他已壮烈牺牲，一时悲痛万分，晕倒在船上。至此，长达7年的朝鲜战争方才结束。这场战争实际是因丰臣秀吉的病死而早日结束的，它暴露了明朝军队的虚弱，政治的腐败。
