张献忠虽然在成都建立了大西政权，但他面临的敌人不仅是清军，更有明朝在四川的残余势力，如： 王应熊及王祥在遵义，马乾、曾英在重庆，范文光、曹勋在洪雅，詹天颜在松茂，谭宏、谭诣在夔万，樊一蘅在纳溪。这些明残余势力虽结寨自保，但也时时窥测时机，向大西军进攻，对大西政权派往各地的官员，或暗杀，或明杀，十分残忍，甚至在一县之内，三四个月就有10余个县官被杀。官僚地主阶级反攻倒算加上清统治者派肃亲王豪格和吴三桂南下汉中，准备进川，迫使张献忠不得不考虑新的战略。
顺治三年 (1646年) 夏，张献忠决定撤出成都，北上西安，再求发展。临行尽焚成都宫殿，以示一无反顾之心，指定孙可望、李定国等四将军组成一个二线领导集团，以备不测。
这时，大西军共有五六十万，沿途旌旗蔽野，浩浩荡荡，十二月进抵西充的凤凰山。叛徒刘进忠在这时背叛了农民军，带一支队伍投降清军，并为清军带路。一天，刘进忠带清兵到了凤凰坡附近，正遇天下大雾，张献忠起早出发，突然遇上刘进忠和清兵，清兵一齐发箭，正中张献忠头部，张献忠坠下战马，爬到一柴垛中隐藏，结果被发现，捉住斩首。
张献忠牺牲后，豪格分兵四出追击，大西军损失二三十万人。此时第二线领导当机立断，改变北进方针，转而南下，由顺庆出发，一昼夜驱驰数百里，从而保存了大西军的一部分力量。
