山东的农民起义在明末就已蓬勃发展起来。顺治元年 (1644年) 九月间，李自成西撤，而闯王旗帜仍飘扬在山东各地。兖、沂、邹、滕广大地区的农民军，成为截击清军南下的重要力量。兖、沂所属州邑，农民抗清队伍达数十支，最大一支达几万人，如满家洞农民军在二三百方圆的地区，聚集数万之众，他们建营寨，攻城池，各种兵械，无不具备，旗帜上大书 “闯” 字，官兵望风而走。邹、滕一带农民军也有数十支，其中滕峄农民军，能主动团结其它起义队伍，以苍山、花盘山、抱犊岗一带为抗清基地，坚持抗清达八、九年之久。
山东半岛的登、莱、青三府农民群起抗清，顺治元年 (1644年) 秋，在青州杀死清朝的招抚使。这些抗清的民众，声势浩大，有的称山东提调总镇，有的称总兵大元帅。顺治三年 (1646年) 八月，农民起义军攻克高宛、长山、新城等县。鲁西曹州一带的榆园农民军，曾是一支坚持反抗明朝的队伍，清军占领北京后，他们根据变化了的斗争形势，改为抗清斗争。李自成殉难后，他们执行广泛联合各阶层抗清势力的政策，数日之内，袭陷四城，聚众达数十万，在冀、鲁、豫交界处，形成为抗清的中心。
在河南的大顺军，当李自成西撤以后，仍有2万余人，他们渡黄河向北攻击怀庆、卫辉，推动了新乡、原武等地农民的抗清斗争，与河北、山东的起义军联成一片，牵制着清军南下。
