顺治五年 (1648年),河西回民不堪满洲贵族的民族压迫,乘清军入川之机,发动了声势浩大的抗清起义。其领袖人物是回民米喇印、丁国栋。起义伊始就把矛头指向清朝在甘肃的衙门,镇压了甘肃巡抚,迅速攻下凉州,占领巩昌、岷州、兰州、临洮、渭源,控制了整个陇西地区,使关辅大震。
为了扑灭回民抗清的烈火,清政府任命固山贝子吞齐为平西大将军,同固山额真宗室韩岱统率满蒙大兵前去围剿,在回民义军拒绝清军的威胁利诱以后,清军分三路进攻,攻陷了巩昌、临洮、兰州等城邑。继而,清兵渡过黄河,米喇印在水泉 (永昌县西北) 英勇战斗牺牲,清军进入凉州 (武威)。在受挫的情况下,丁国栋集结余部,由甘州 (张掖) 进据隶州 (酒泉),拥立哈密巴拜汗之子土伦泰为王,继续战斗,受到回族人民的支持和拥护,新疆哈密和吐鲁番一带的维吾尔族人民也来援助。
顺治六年 (1649年),回民抗清义军与山西抗清义军遥相呼应,陕、甘一带再次震动。这年的十二月,清军集中兵力围攻肃州。丁国栋在军事上犯了保守主义错误,在政治上不注意组织和团结更广泛的回民群众,当清兵围城时,他只凭少数兵力,孤军死守,最后,矢尽粮绝。丁国栋、土伦泰和大部分抗清战士壮烈牺牲。但其余部仍坚持斗争,到顺治十年 (1653年) 底,才被清军最后镇压下去。