陕西是李自成的家乡，山西是李自成控制的地方，甘肃又较早受到明末农民起义的波及。所以，这一带人民群众有较好的革命斗争基础。
顺治元年(1644年)，清军进入山西，即遭到大顺军的反抗。当地农民纷纷占山结寨，抗击清兵。顺治五年(1648年)，李自成早已在湖北殉难，但斗争的火种在山西并未熄灭，大同总兵姜瓖起兵反清，攻下朔州、岢岚，几乎将晋北重镇大同攻克。顺治六年(1649年)，晋陕义军携手，攻下汾州府，拥众十数万，截断平阳、潞安两府之间的大路，声势所及附近各州县。在晋东北，五台、繁峙、静乐之刘迁、张五桂等，联结宁武之姚举义军，占据忻口，攻打崞县，使太原北路不通，音信断绝。在晋西北，宁武、偏关、河曲、兴岚等州县的广阔领域，皆为义军所占领，清统治者派亲王尼堪前来镇压，围宁武不下，又攻大同，而义军则乘机据保德、下交城，直逼太原，清山西地方官吓得丧魂落魄，哀号“省城孤悬一土，势切危急”，“呼吸危亡，朝暮难保”，甚至恳诚向朝廷求救速发大兵。清政府十分惊恐，多尔衮亲自到山西，住在浑源指挥，并以博洛为定西将军进攻汾州。义军在清军强大攻势下，经过几年斗争而失败。但以任亮、傅青山等为首的交城山区人民一直坚持到康熙十年(1671年)，还在战斗。
在陕西，明旧将与农民军联合攻兴城，克紫阳、秦川、蓝田、兴安。陕北的延安、陕南的雒南、商州的抗清斗争达10年之久。
在甘肃，顺治五年(1648年)三月爆发了米喇印、丁国栋的回民起义，连续攻下凉州，巩昌、岷州、兰州、临洮、渭源等地。