台湾既平，康熙皇帝欲周知全国土俗民情，又因黄河频繁决口，社会十分动荡，决定亲自视河，访察江南，便于康熙二十三年(1684年)九月，自北京出发，十月到达济南府、泰安州，登泰山，至郯城。河道总督靳辅受到皇帝的接见，康熙皇帝对靳辅说： “黄河屡次决口，久为民害，朕欲亲至其地，视察形势，察看河堤的修筑情况，马上就去。” 于是在靳辅的陪同下，康熙皇帝到了黄河北岸，检阅河工及各险要地段，下令于黄河两岸增设堤防。又到清河，检察天妃水闸。康熙皇帝见此处水势湍急，下令改为草坝，另设七里、太平二闸以分水势。
十一月，康熙到了江宁 (今南京)，登雨花台，拜谒明太祖朱元璋之陵墓，经过明故宫时，慨然长叹。
然后由江宁返回北京，在经过清口时，又检查了黄河南岸的险要地段。
康熙皇帝一生，六次南巡，往返供应主要由国库开销，沿途行宫不设彩帐，比较俭朴。
康熙南巡的目的是调查研究，特别是为了视察治河工程和收拢南方的民心。作为一个封建皇帝，他的这一作为是极为可贵的。他的后代，如乾隆皇帝也继承了这一传统。不过，乾隆皇帝下江南已有更多游山玩水的成分，往来也大讲排场，扰害地方，大不如其先辈了。
