光宗早死,王朝又面临继嗣问题。皇长子朱由校已16岁,但还没来得及册立为太子。一般太子继位,太子妃随之转为皇后,光宗即位时,太子妃郭氏已死,所以最得宠的李选侍便随他入居乾清宫。李选侍看出光宗不久人世,便把皇长子朱由校拉在身边,并催皇帝赶快封自己为皇后,但终于未能办成。光宗驾崩,李选侍把朱由校藏起来,叫内守住大门,不许大臣入内,想借机与大臣讨价还价。群臣来哭临,到宫门被阻,兵部给事中杨涟大喝一声: “我们是皇帝召来的,皇帝已经驾崩,你们拦在这里,想干什么?” 内侍退缩了,群臣便直入宫中,哭临已毕,群臣才发现皇储并未在场,便闹了起来,有人大叫: “哪个大胆的,敢把新天子藏起来?” 内监王安入内见李选侍,说明了利害,她一松手,王安赶紧抢出皇子。群臣一见,高呼 “万岁”,七手八脚把皇子扶上轿子,并马上把他送往慈庆宫。这时,宫内传出“哥儿回来! 哥儿回来!” 的叫声,先后冲出三批太监来抢皇子,都被大臣挡回。朱由校来到东宫,被册立为太子,大家商定把李选侍赶走后,在九月初六日行即位礼。实际上,朱由校并不是李选侍的亲子,其生母王选侍就是被李氏殴打后病死的,所以他也不愿回到李氏身边。于是群臣纷纷上疏要求李氏搬出乾清宫,其中御史左光斗的言论最为激烈,斥责李氏想学武则天。但李氏仍在拖延,至九月五日,乾清宫还没腾空,第二天就是即位大礼了,群臣积愤已极,在宫前叫嚷,喧声达于宫廷深处,李选侍被吓住了,只好赶快搬出。由于搬迁太匆忙,内侍乘机偷盗,怀揣沉重的金宝走出,有的在宫外摔倒,金银撒了一地。新帝非常愤怒,惩处了一批内侍,又牵连到李氏。此案和梃击、红丸合称明末三案。