为对付日渐严重的倭难，嘉靖二十六年，朝廷任命朱纨为浙江巡抚，兼管浙闽军事。朱纨到任，推行严厉的海禁政策，下令将所有双樯的海船全部销毁，违者斩首，并积极练兵，严格纠察，抓到勾结倭寇的奸商，立刻斩首。当时通倭的大都是有权势的豪强官家，朱纨的措施使他们惴惴不安，便通过各种途径攻击他专权滥杀，致使朱纨罢官待审，面对盘根错节的闽浙势家，他哀叹说： “去外国盗易，去中国盗难，去中国濒海之盗犹易，去中国衣冠之盗尤难。” 他愤而自杀。此后提起防海大事，朝野人士都摇手不敢开口，海盗更加猖獗。嘉靖三十一年，朝廷又派王忬总领军事，他重用俞大猷、汤克宽等将领，数次击败倭寇，并派密探搜捕内奸，沿海为内应的豪强一扫而光，使倭寇失去了耳目。嘉靖三十三年，张经代替王忬总督东南诸省军务。张经积极练兵，又从两广调来狼士兵，在没作好准备之前，他下令不许轻战。三十四年，倭寇大举进犯，杭州被围，数十里外，血流成河。这时，严嵩的亲信赵文华来浙，崇信道教的世宗派他来祭海求平倭难，并让他监督军务。赵文华下车伊始，便催促张经赶快出击，张经自以为官位比他高，没把作战计划告诉他，赵文华便告了刁状，说张经畏敌不前，想等敌人逃走后再杀余寇请功。世宗听信，下令逮捕张经，令未到，张经已打了大胜仗。狼士兵到达浙江后，张经令几路明军合击嘉兴以北的一伙海盗，把其赶至王江泾中，斩首二千多级，溺水而死者无数，取得了抗倭以来的第一个大胜仗。这时许多官员都认为不宜更换主帅，可昏庸的皇帝听从严嵩的胡言，认为张经是被弹劾才勉强出战的，这次大捷是赵文华督师有功才取得的，竟然赏赐赵文华，而仍将张经等下狱，不久将他斩首。