在对象化思维过程中，根据客观事物具有的系统特征，从事物整体出发，着眼于整体与部分、整体与层次、整体与结构、整体与环境的相互关联和相互作用，求得系统整体目标优化的综合思维方法。
系统思维方法，是伴随着系统科学(系统论、信息论、控制论、耗散结构理论、协同学和突变理论等) 的发展而逐步升华形成的。系统科学作为揭示客观事物的系统性特征的科学，在纵向和横向两个角度改变着人们的认识方式，随着人们现代系统认识世界方式的形成，也出现一系列系统思维方法，如信息方法、控制方法、反馈方法、协同方法、突变方法等等。
使用系统思维方法的程序：一是要理解系统思维方法使用的原则： 整体化原则、层次化原则、结构化原则、相关化原则和目的化原则。二是要立足系统整体、统筹全局，使整体与部分、系统与环境辩证地统一起来。三是要选择好系统目标，围绕系统目标的实现来思考系统内部层次结构、部分与部分之间的协调关系。四是要研究选择实现系统目标的具体方案，通过对各种方案的分析、比较，最后选出优化方案。五是要科学组织实施具体方案。六是要注意定性和定量分析。七是要充分发挥群体思维作用。